性行为的风险主要有三个方面：即身体的损害、心理的损害和计划外怀孕。
身体的损害是指性行为会伤害身体。现代科学证明，性交活动可以促进体内产生多巴胺，可以使细胞内分泌的“内啡肽”活化；甚至按摩也可以提高体内5-羟色胺的水平。这些都有一定的抗痛、松弛身心和提高免疫力的作用。但是性行为不当也会损害身体的健康。在过度劳累、醉酒后、月经期间、妊娠期、产褥期、生病期间的性行为都可以损害身体的健康。而一方患病时也有感染对方的机会；心情恶劣时，整个身体的状况会处于一种亚健康状态，性行为所产生的剧烈冲击，可能会加重这种亚健康状态，这时身体中比较薄弱的内脏器官就可能患病。
心理的损害是最伤夫妻感情的。特别是一夜情，是最不安全的性行为。一方面，由于不了解对方的身体状况，对方有可能患病从而传染给另一方。另外，性行为中过分激动的表现也会诱发自身器官中已有的疾病，特别是心脑血管系统的疾病，甚至会暴死于性活动中。另一方面，很多人在婚外性行为以后常常出现比较严重的心理后遗症，如担心自己被感染上性病、担心被家人特别是自己的配偶知道等，心理上后悔、自责甚至长期忧虑、惊恐，从而损害健康。所以说，夫妻间的性行为才是最健康的性行为。
有避孕措施的性行为一般不会导致计划外怀孕。避孕可由男方也可由女方来实施；可事前也可事后避孕；可一次也可长期甚至永久避孕。