乳腺导管内乳头状瘤最有效的方法是手术治疗，药物治疗通常只能减轻症状。以下我们简要介绍手术及中医中药疗法。
(1)手术治疗：是本病的首选治疗方法。术前均应行乳导管造影检查，以明确病变的性质及定位。术后宜做石蜡切片检查，因为冰冻切片检查在辨别乳腺导管内乳头状瘤和乳头状癌时最困难，两者常易发生混淆，故不宜以冰冻切片表现为恶性依据而行乳房根治术。
如果为单发的乳腺导管内乳头状瘤，手术时将病变的导管系统切除即可;如果为多发的乳腺导管内乳头状瘤，因其较易发生恶变，则宜行乳腺区段切除，即将病变导管及其周围的乳腺组织一并切除。对于那些年龄在50岁以上者，造影显示为多发的乳腺导管内乳头状瘤，或经病理检查发现有导管上皮增生活跃甚至已有上皮不典型性改变者，则宜行乳房单纯切除，以防生变。
(2)中医中药治疗：因乳腺导管内乳头状瘤多以乳头溢液为主要症状，故中医称之为“乳衄”。一般认为乳衄多为肝郁火旺或脾虚血亏引起，故治疗应以疏肝解郁、清泄肝火及益气健脾、养血摄血为法。
①肝郁火旺型：乳孔内溢出鲜红或暗红色液体，乳晕部可触及肿块。伴有烦躁易怒，乳房及胸胁胀痛，口苦咽干，失眠多梦。舌红，苔薄白或微黄，脉弦。治法：疏肝解郁、清泄肝火。方药：丹栀逍遥散加减。丹皮9g，山栀9g，柴胡6g，当归9g，赤芍12g，橘叶9g，川楝子9g，制香附9g，夏枯草15g，侧柏炭9g，藕节炭9g，生甘草6g。
②脾虚血亏型：乳孔内溢出淡红或淡黄色液体，乳晕部可触及肿块。伴有面黄倦怠，食少便溏，虚烦少寐。舌淡，苔薄白，脉细弱。治法：益气健脾、养血摄血。方药：归脾汤加减。炙黄芪15g，党参9g，白术9g，茯苓9g，当归12g，白芍12g，龙眼肉9g，远志6g，藕节炭9g，炙甘草6g。
乳腺导管内乳头状瘤疗效标准：
(1)治愈：乳头溢血停止，瘤体消失。
(2)好转：乳头溢血减少，瘤体缩小。
(3)未愈：乳头溢血不减，瘤体不变或反增大。