男性与女性的生殖器官结构上截然不同，当然自慰方式亦不相同。一般来说，男性的自慰方式是手轻握住阴茎，上下挪移包皮，施以刺激。此外，两手掌夹住阴茎，互相搓揉加以刺激，也是一般常见的方法。
另外一种方法是一手握住阴茎，以另一手的手指或手掌刺激龟头，或是以食指与中指夹住龟头施以刺激。
进行自慰的姿势有仰躺、侧卧、坐着等，依人物、场合的不同而不同。刺激阴茎时也可利用乳液或橄榄油。
就男性来说，自慰时很少使用道具，但也并非完全没有。将阴茎插入留有余温的截口中，是自古相传的方法，最近市面上也贩售自慰用的器材，但这并非常见、一般的方法。在女性方面，自慰方法也是因人而异，一般最常使用的方法是仰躺，利用手指刺激阴蒂、阴道口、阴唇或者是乳房等部位。
此外，还有以匍伏的姿势，手指对生殖器官施以刺激、手掌压迫耻丘；或是两股间夹着毛毯或枕头；以床缘对生殖器官施加刺激等方法。
以上是女性自慰的主要方法，除此之外，还有以站立、半蹲、坐下等姿势，以桌子、椅子等磨擦大腿、刺激生殖器官，或是入浴时，以莲蓬头的水柱，刺激阴蒂或阴唇等方法。
女性进行自慰时，以手指或异物插入阴道的情形，并不如男性想像中多。根据调查的结果只有约百分之三十。在这种情况下，最常使用的工具当然是手指，此外有卫生棉条、梳子柄、蔬菜、口红盒、电动按摩器等各式各样。
在自慰时刺激肛门的情形男性较少、女性较多。一般的作法是以指尖刺激肛门，但也有同时以手指插入阴道和肛门，并刺激阴蒂的自慰方法。
无论是男性或女性，在自慰时使用道具，必须十分注意小心。尤其是对于尿道的刺激，最好不要使用道具做插入的举动。在医院门诊时常发生以发夹或针刺激尿道，造成伤害或无法取出的案例。而且，对女性来说，尿道很短，异物容易进入膀胱，发生这种事情就非开刀不可了。
对于插入阴道的用器，也要选择高安全性的物品，尖锐的物品容易伤害阴道壁，尤其是电光球、玻璃等易碎物品，若插入阴道，阴道一用力收缩，就会破裂割伤，十分危险。女性阴道处于兴奋状态时，会因黏液的润滑而使异物比想像中插得更深，阴道内也会因黏膜产生吸着、紧闭的结构，而使插入的异物无法取出。无论如何，必须谨记，千万不要将危险物品插入体内。