有些正常的男性虽然他们的睾丸发育正常,但他们的阴茎却比较短小,虽然也能够勃起和射精,但常常会造成性心理上的异常,甚至于怀疑自己的性能力,在我国虽然还没有对这些短小阴茎者在男性中所占的比例进行过科学的统计,但从日常生活中所遇到的情况来看,这类病人的确还不算少。国外的性医学专家的研究表明，男性的阴茎短小主要与下列因素有关：1.阴茎增大与遗传因素阴茎与身体其它器官一样，其大小及形态特点要受遗传基因的控制与影响。
2.阴茎增大与发育与营养状况一般来说,成年男性体格健壮,身材高大,其外生殖器包括阴茎、阴囊的发育也较好，阴茎可能较为粗大，反之则可能小一些，但是值得指出的是，阴茎的大小不会与身高成正比例，常可以见到一些身高不足1.60米的男性,其阴茎勃起时可以达到18厘米以上。
3.阴茎增大与肥胖也有一些关系，一些小腹部、耻骨联合部、会阴部脂肪丰满突出的男性，往往阴茎的发育欠佳，比起正常男性的阴茎会相对短小。的确，与肥大的身体相比，这种短小的阴茎在婚后可能会给性生活带来一定的困难和不理想。
4.阴茎增大与其它方面也有关系，如内分泌紊乱,男性激素水平不足,阴睾或阴囊肿胀产生的阴茎回缩等，都可能造成阴茎短小。
目前，我国虽然尚未对小阴茎者在男性中所占的比例做过科学的统计，但从临床中所遇到的病人和接受手术的人数来看，有这种生理缺陷的人不在少数，他们中大多数婚后的性生活不可能会很满意，因此他们要求手术治疗的心情往往是十分迫切。近年来，国内外的整形外科学者对小阴茎的整形做了大量的研究和临床实践，其主要目的有两条，一是延长阴茎，再就是增粗阴茎。我国同济医科大学的龙道畴教授发明了一种延长阴茎的好方法，主要是通过松解切断附着在耻骨处的阴茎浅悬韧带，松解阴茎深悬韧带的方法，使阴茎在勃起之后避免受到阴茎悬韧带的牵拉；同时将阴茎背侧皮肤做Z成形术，术后一般可使短小阴茎增长2-4厘米;对一些伴有阳萎的小阴茎患者,还可以采用内置银丝的硅胶条插入两条阴茎海绵体之间,借以增大和加粗阴茎,此法的优点是手术方法相对简单,安全,并在性生活时可有效地加强性刺激度,但其缺点是置入的阴茎硅胶假体有可能被排异出来,部分人可能在术后有阴茎异物感,至今在日本国仍有不少的医院采用这种方法。
在阴茎增粗方面，引进了脂肪颗粒注射的办法以达到增粗阴茎的目的，效果较为理想。对于对做手术有顾虑的人，还可以采用男性生殖器负压治疗器进行非手术治疗，这种治疗器利用对阴茎的负压吸引牵拉，可增加阴茎的动脉供血，使阴茎海绵体组织充盈，静脉回流受限，从而使阴茎得以不断增大，通常每日早晚各进行一次充盈训练，持续时间为30分钟,15天为一疗程,一般2-4疗程后,短小的阴茎均能获得一定程度的增长和增粗。当然，这要求病人的内分泌功能正常，血中的睾丸酮水平也应在正常范围之内。有关专家以为，这是一种物理性与心理治疗相结合而又不干扰内分泌功能的较理想的非手术整形方法，除此之外，此法对于阳萎、早泄、不射精等异常情况也有一定的治疗效果。